解放前，縣內古樹多為個人所有，管理工作基本上是由樹木產權人自主管理。新中國成立后， 銀杏古樹多收歸集體所有，1958年大躍進大煉鋼鐵時期，部分古樹砍伐嚴重?！拔母铩逼陂g，古樹名木資源再次受到了較大破壞。十一屆三中全會之后，縣委、縣政府加大了對銀杏古樹資源的保護管理力度。1983年縣政府農業區規辦公室在全縣范圍內開展農業區劃普查工作，對全縣銀杏古村資源進行了普查，全縣百年以上銀杏古樹為28 000株。2004年夏，縣政府統一安排，由縣林業局牽頭，投資30余萬元，開展銀杏產業普查工作。從縣林業局及各鄉鎮林業站抽調40余人，分為兩個組，即外業調查組和內業匯總組，外業調查組24人，分為6個調查組；內業組12人，負責調查數據匯總，歷時兩個月，完成全縣銀杏產業普查任務。對全縣胸徑0.25米以上的定植銀杏樹進行逐株調查、建檔，并建立了郯城縣銀杏古樹資源數據庫。2001年，根據省、市林業局的要求，縣林業局組織對全縣古樹名木進行一次小規模的普查。2011年1月，縣林業局投資20萬元， 組織開展對全縣古樹名木普查及掛牌保護工作。 共抽調30余人，分為4個組，歷時40余天，對全縣現存古樹名木進行普查，并首次利用GPS全球定位系統對全縣古樹名木進行衛星定位。對認定的銀杏古樹進行統一登記，設置標志，修建護欄進行保護。對全縣銀杏大樹、古樹資源建立動態數據庫，對胸徑大于0.25米以上的銀杏定植樹編號掛牌，登記造冊、建立檔案。2011年10 月28日，縣綠化委員會組織縣林業局、縣城管局、縣文化局等相關單位，在縣林業局召開古樹名木審查論證會議，聘請10多名專家組成了“古樹名木審查論證專家委員會”，對全縣古樹名木進行審查論證。

2010年5月開展集體林權制度改革工作。 縣林業局抽調25名業務骨干，組成5個調查組，分鄉鎮，逐村逐地塊開展調查。對全縣古樹名進行了確權。對農戶宅院、宅旁隙地和屬于個人的銀杏樹，堅持“誰栽誰有”的原則，樹權永遠歸個人，并確權發證，允許繼承。林網銀杏、間作銀杏和銀杏片林，以產權制度改革為突破口，明晰所有權。凡在承包地進行銀杏種植的，承包期應保持相對穩定，不得隨意終止合同，單方終止合同的，一切損失由違約方承擔；承包期滿的， 由原承包戶優先續包，原承包戶不愿繼續承包的， 可以對樹木折價轉包給他人，但無論何人承包， 都不準毀壞銀杏古樹。村集體所有的銀杏大樹古樹由鄉鎮政府統一管理，不得隨意轉讓、私自采挖、出售或變更銀杏林木的所有權。由于村莊規劃、園區建設、水利建設工程等確需移挖銀杏大樹的或變更銀杏林木所有權的，必須經所在鄉鎮人民政府、縣林業主管部門批準。

2007年12月縣政府制定《關于加強銀杏大樹古樹資源保護管理的暫行規定》，對銀杏大樹采挖移栽植行為進行規范，制定出了嚴格的程序。對列入保護區的銀杏樹、百年以上銀杏古樹、防護林、風景林、母樹林以及名勝古跡、革命紀念地銀杏樹木禁止移植。對確因基本建設征占用林地或道路拓寬、舊城改造等特殊情況，需要移植樹木的，需由建設單位提出申請，報林業等有審批權的部門審批后，在林業技術人員指導下方可移植。對經營、運輸銀杏樹木進行了規范。

2004年，縣政府成立了銀杏產業發展和保護基金，將銀杏古樹的保護納入年度財政預算， 縣財政每年拿出200萬元用于保護銀杏大樹古樹資源，銀杏重點鄉鎮同時按照3:1的比例拿出相應的配套資金，設立銀杏古樹保護管理基金。 2004年至2009年，投入到古樹名木保護的資金800余萬元。一是對古樹名木設欄保護，對部分樹勢弱的古樹進行復壯；二是對個人古樹名木給予補貼，確保管護到位；三是廣泛采取古樹認養等形式，充分調動社會各界參與古樹名木保護管理的積極性。由政府與樹木擁有者簽訂管護責任狀，落實責任，并在經濟上給予一定的補貼，確保管護到位。

1996年以來，依法加強對古樹名木的保護管理，對砍伐、販賣和毀壞古樹名木的行為，加大懲戒力度，體現出與一般樹木毀壞行為的差異。 自2009年以來，全縣共查處非法采挖、運輸銀杏古樹案件60余起，處理責任人員107人，從根本上遏制住了非法采挖銀杏大樹古樹行為。

堅持“保護為主，合理利用，加強管理”的原則，把古樹名木保護同經濟建設結合起來，納入城鄉建設規劃，對全縣的銀杏古樹資源合理開發利用。充分利用新村“老神樹”和萬畝古銀杏群的知名度和自然景觀，大力開展旅游產業，通過提取旅游收入的部分資金作為保護基金，更好地保護古樹資源，實現經濟發展與古樹保護的雙贏。