付慧敏(2006)從隨州市曾都區中坪、劉家橋、草店、殷店、胡家河、張畈、小嶺沖、九口堰，安陸市候沖、仁合、錢沖、三沖古樹群體中共采集了134株古銀杏的種子樣品，對其種核特征和種仁營養成分兩個方面進行了初步研究。結果表明:在銀杏種核特征指標(長、寬、厚、單核重、長寬比、厚率、長厚比)中，除厚度外，其他各特征在單株間都存在著顯著或極顯著的差異，種核特征變異十分豐富。無論是群體間還是群體內，都是出仁率變異幅度最小，單核重變異幅度最大，種核其他特征指標處于兩者之間。根據銀杏的單核重與種核其他特征的相關性，在銀杏選擇育種中，除了選擇大粒型的銀杏外，最好選擇種核寬度較大的銀杏。隨州和安陸的銀杏種核類型有4類，以馬鈴類和梅核類為主，佛指類和圓子類很少，沒有長子類銀杏。無論是類型間還是類型內，主要有機養分中可溶性糖含量差異最大，淀粉含量差異最小;礦質元素中氮元素及銅元素含量差異較大，鎂元素含量的差異最小。在以產地劃分的銀杏古樹其群體水平也存在著類似的現象。銀杏種仁營養成分間的相關性以及它們與種核特征間的相關性比較復雜，在確定目標性狀時應參考各因素間的具體相關性，制定最佳的目標性狀和方案。群體內銀杏種核特征及種仁營養成分含量的變異系數未必低于群體間的變異系數。因此，在選擇育種時既要重視群體間優良基因型的選擇，也要重視群體內優良基因型的選擇。銀杏古樹種核特征指標和種仁營養成分含量沒有明顯的地域性差異。根據種核特征和種仁營養成分含量，初步選出了一些單株，作為進一步選擇育種的基礎。王琳(2008)用9條ISSR引物對120個銀杏單株種核胚乳的基因組DNA進行PCR擴增，共得到145條清晰的擴增譜帶。其中，多態性譜帶116條，多態位點百分率(PPB)為80%。在總體水平上，Nei's基因多樣性HE為0.269，Shannon's多態性信息指數Ho為0.401，表明隨州和安陸銀杏種核在總體水平上具有較廣泛的遺傳變異。

    從1993~2002年湖南省安化縣林業科學研究所從全分布區、長江中下游地區、湘西山區等地理區域內，分別對種源、母樹采集種子。對銀杏種源、家系、無性系選擇研究進行了國內較系統的古銀杏雌株研究。該項目:①明確了銀杏核用良種的最佳選擇途徑為無性系選擇，葉用良種的最佳選擇途徑為種源、家系聯合選擇，材用良種的最佳選擇途徑為家系選擇;并指出在核用良種選擇工作中，應該把種核殼厚度、種仁總糖濃度列入目的性狀之中，而對種核出仁率、種仁淀粉濃度不加測定也無妨。②初步提出，湖南鳳凰、江蘇泰興與邳縣、河南嵩縣、湖北安陸、遼寧丹東、重慶等7個產地所產銀杏種核，風干重較大、殼較薄、出仁率較高;江蘇吳縣、浙江臨安、河南新縣、廣西全州等4個產地所產種仁，蛋白質、脂肪、淀粉濃度都較高;廣東南雄所產種仁總糖濃度較高。在試驗地，河南嵩縣種源的銀杏苗木，葉片中總黃酮、總內酯濃度較高;遼寧丹東、山東郯城種源的苗木，葉片中總黃酮濃度較高;湖北安陸、湖南新寧種源的苗木，葉片中總內酯濃度較高。湖南新寧與安化、遼寧丹東、湖北安陸、浙江富陽、廣西興安、安徽金寨等7個種源和18、19、22號，丹東1號，新寧2、7、11、17號，安化1、10號，興安22號，金寨4號，安陸4號等13個家系的銀杏苗木，具有早期速生特性。據評估，在安化縣境內初步推廣上述材用速生種源，每年已產生經濟效益71萬元。③研究發現，銀杏種核長寬比與殼厚度呈負相關，種仁Ca、Mn濃度與總糖濃度呈正相關，苗木單葉干重與葉片內酯濃度呈正相關，苗木基徑與生物量的相關比苗高與生物量的相關更為密切;在銀杏全分布區內，種核風干重、種仁Mn濃度的地理變異都可能屬經向漸變模式，種仁K濃度的地理變異屬緯向漸變模式，種核長度與長寬比、種仁脂肪濃度的地理變異都屬(或可能屬)經一緯漸變模式;在長江中下游地區內，1年生苗高的地理變異屬緯向漸變模式。這些規律在生產和研究工作中具有參考價值。本研究對我國古銀杏資源利用及核用、葉用及材用新品種創造奠定了良好基礎。

汪貴斌等(2009)以福建寧化縣32株古銀杏樹當年生種子為研究材料，對種仁的特征進行了較為系統的研究，研究結果表明:①32個銀杏單株種仁的仁長、仁寬、仁厚、出仁率、可溶性糖含量和蛋白質含量等指標的差異均達極顯著水平，淀粉含量的差異也達顯著水平，出仁率位于前三位的是28、25、17號，可溶性糖含量位于前三位的是20、14、8號，淀粉含量位于前三位的5、19、8號，蛋白質含量位于前三位的是2、32、11號。②種仁性狀變異系數由大到小的順序依次為蛋白質含量>單仁重>淀粉含量>可溶性糖含量>仁長>仁寬>仁厚>。③相關分析結果表明，除了可溶性糖含量、淀粉含量、蛋白質含量與其他測定指標之間均未達到顯著相關水平外，其他測定指標之間大多數顯著相關，其中單粒重與單粒體積、核長、核寬、單仁重、仁長、仁寬、仁厚都存在極顯著相關。