歷來的植物分類學和樹木分類學教科書，均將銀杏這一植物劃入裸子植物的范疇。這種劃分方法，主要是根據銀杏的花果結構而加以確定的。

  但是銀杏和一般裸子植物又有所不同。其最大的不同之處在于它有寬大的葉片和帶有漿汁外種皮的種子。因此在林業界把裸子植物中具有針葉或鱗葉的松柏類植物列入針葉樹種，而卻把銀杏列入闊葉樹種。所以銀杏雖與松柏類周屬裸子植物，但在一般入看來，銀杏與被子植物中的楊、柳極相類似，因而常常把銀杏的雄花稱為葇荑花序，把銀杏的種子稱作果實（漿果或核果）。嚴格說來，這些稱謂都是不恰當的。但是習慣了的稱呼一時很難改變，因此至今許多人依然把帶有漿汁外種皮的銀杏種子稱作銀杏果，把銀杏的種核稱作銀杏種子。對于這個問題雖然沒有必要過多的討論，但是對銀杏的花果特征和銀杏在植物學中的分類地位有一個比較清楚的了解，還是完全必要的。