關于銀杏雌雄株的早期鑒別方法，根據其外表形態、生長速度和物候期等特征，有許許多多的零星報道，但是這些方法，既缺乏明確的標準，又由于樹齡、地域、品種或類型等等變化多端，難以應用。有人曾經報道，銀杏雄株葉片的上表皮上具有氣孔，李正理( 1959) 通過研究，否定了這一結論。利用銀杏染色體上的“隨體”來判別銀杏的雌雄或用同工酶鑒定銀杏的性別較為可靠。但是，這些方法應用起來比較麻煩。從銀杏生產的實際情況看，早期能否判別銀杏的雌雄似乎無關緊要。因為當前的銀杏種子生產不論原來是雄性或雌性，大都可以通過嫁接的方法更換優良品種，而嫁接方法極為簡便，很容易改變樹冠的雌雄性別。

    銀杏雌雄株細胞中的染色體均為2n＝24,即單倍染色體的數目為n＝12。李正理(1959)、 韓一凡( 1980)、陳瑞陽(1982)，黃少甫(1985)，李林初(1986)等均進行過這方面的研究。陳可誅( 1983)還利用Giemsa C-帶技術證明了在銀杏12對染色體中，只有兩對染色體呈現末端帶。銀杏為2型（或雜合）染色體核型。二型核是核型變化的末期階段，因此，有人認為銀杏細胞的這種核形情況也說明了銀杏樹的古老程度。